Las piezas de la colección conforman los elementos que sirven al visitante de este museo para establecer un recorrido histórico-cultural de la Sierra Alta del estado de Hidalgo: desde reproducciones de pinturas rupestres en peñas y abrigos rocosos (huellas grabadas en la época prehispánica, en diferentes municipios de la zona), la memoria física del virreinato (ejemplos de la arquitectura civil del siglo XVI), hasta los efectos de las guerras de Independencia y Revolución en tierras serranas.
El museo está dispuesto en cuatro espacios que reflejan el desarrollo de la historia de la Sierra Alta hidalguense:
1. Época prehispánica
2. Época virreinal
3. Independencia y Revolución
4. Arte y Tradición popular
